Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC5Q9UQL6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms