Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRQQ9UMZ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms