Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND2AQ9ULE3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms