Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA2Q9UL42 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms