Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC13A4Q9UKG4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms