Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH22Q9UJ99 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms