Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms