Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF4Q9UHB7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF4Q9UHB7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF4Q9UHB7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF4Q9UHB7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF4Q9UHB7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF4Q9UHB7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF4Q9UHB7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFF4Q9UHB7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFF4Q9UHB7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFF4Q9UHB7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFF4Q9UHB7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFF4Q9UHB7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFF4Q9UHB7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms