Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGK8

SERGEF, Secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEFQ9UGK8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERGEFQ9UGK8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERGEFQ9UGK8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms