Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NXF1Q9UBU9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms