Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN10Q9UBB4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms