Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP36Q9P275 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms