Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms