Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTMR4Q9NYA4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms