Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM28Q9NW13 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM28Q9NW13 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBM28Q9NW13 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBM28Q9NW13 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms