Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms