Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ASF1BQ9NVP2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ASF1BQ9NVP2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASF1BQ9NVP2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASF1BQ9NVP2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASF1BQ9NVP2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASF1BQ9NVP2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASF1BQ9NVP2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASF1BQ9NVP2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASF1BQ9NVP2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASF1BQ9NVP2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms