Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO28Q9NVF7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms