Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L1Q9NU39 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms