Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECHDC1Q9NTX5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ECHDC1Q9NTX5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms