Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC6A13Q9NSD5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms