Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELLSQ9NRZ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HELLSQ9NRZ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms