Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FSCN3Q9NQT6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms