Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN4Q9NQP4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms