Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms