Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNRC6CQ9HCJ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRC6CQ9HCJ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNRC6CQ9HCJ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRC6CQ9HCJ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms