Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI0

PARVG, Gamma-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVGQ9HBI0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARVGQ9HBI0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVGQ9HBI0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARVGQ9HBI0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms