Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SP110Q9HB58 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms