Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms