Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUDS3Q9H7L9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms