Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms