Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
SENP3Q9H4L4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms