Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAB3GAP2Q9H2M9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms