Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms