Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF3Q9H094 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF3Q9H094 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms