Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDGFDQ9GZP0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms