Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR3CQ9C0K3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms