Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms