Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INO80BQ9C086 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms