Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT23Q9C075 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms