Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM7Q9C029 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms