Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM54Q9BYV2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms