Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC2Q9BYS8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC2Q9BYS8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms