Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms