Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SF3B5Q9BWJ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms