Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM106CQ9BVX2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms