Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RIOK2Q9BVS4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms