Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3CQ9BUI4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms