Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms