Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A3Q99624 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms